Homeiden ja bakteerien kasvu on yleistä rehuputkiston sisäpuolella. Tämä pätee erityisesti, jos osasto on ollut tyhjä eikä putkia ole käytetty johonkin aikaan. Jo alun perin herkän porsaan ei pitäisi aloittaa ensimmäisiä päiviään syömällä homeista rehua.
Vieroitusripuli ja vähentynyt kasvu sekä siitossioissa että lihasioissa aiheuttavat suuria tulojen menetyksiä, jotka voidaan välttää parantamalla rehuhygieniaa. Tutkimukset ovat myös osoittaneet, että puhdistamalla rehuputkien sisäosat sikakuumeen riski pienenee rajusti.